Слово «кофий» является устаревшей формой слова «кофе», которая использовалась в русском языке до реформы орфографии 1918 года. Причиной изменения стало влияние западноевропейских языков, в частности французского и немецкого, где слово «кофе» произносилось как «кафе».
Реформа орфографии 1918 года привела к упрощению многих слов, в том числе и к изменению написания «кофий» на «кофе». Эта новая форма быстро прижилась в русском языке и стала основным вариантом написания слова.